هناك الكثير من المضاعفات التي ممكن أن تحدث بعد اللجوء الجراحي لمتلازمة الأنف الفارغ و ايضا , متلازمة الأنف الفارغة تعتبر من أحد المضاعفات لأي عملية جراحية في الأنف . بالعادة يفضل علاج المتلازمة عن طريق الأدوية , لكن في بعض المرضى قد يلجأ للجراحة , و تشمل مضاعفات هذه الجراحة ما يلي : 

 

النزيف .

العدوى .

خطر اصابة الهياكل الداخلية كالأعصاب و الأوعية الدموية .

آثار جانبية للتخدير . 

التهاب الجرح .

تجلطات في الدم تعتبر أقل نسبة حدوثها و لكنها قد تحدث . 

فشل العملية و بقاء الأعراض السلبية عند المريض . 

تكون أورام دموية يتجمع فيها الدم و قد تضغط على الجدار الحاجز للأنف و تحدث ثقب فيه . 

ضعف التئام الجروح أو الندوب .

تغيير في الإحساس بالجلد ( خدر أو ألم ) .

صعوبة في التنفس .

تشوه في منظر الأنف أو عدم الرضى من منظره .

تلون الجلد و تورمه .

إمكانية توجب إعادة الجراحة . 

     قد تصل احتمالية حدوث أحد هذه المضاعفات الى أكثر من 5 % . تعتمد بالأغلب احتمالية حدوثها على خبرة الطبيب الجراح و مهاراته في مثل هذه الأمور , فهي كالجراحة التجميلية للأنف , لا يعرف مدى نجاحها الا بعد رؤية المريض للأنف إعطاء رأيه فيه . لكن هنا نرى إن كانت قد اختفت أو قلت شدة الأعراض التي كان يواجهها المريض قبل العملية و مقارنتها بما بعدها . .