من اهم اسباب نقص هرمون النمو هو عدم افراز الغدة النخامية لهرمون النمو وغالباً يكون وراثي يلعب في ذلك وجود جينان متنحيان من الأب والأم على الكروموسوم المسؤل عن تكوين هرمون النمو من قبل الغدة النخامية. او وجود ورم في الغدة النخامية او اسفل الدماغ، ويقال ان الطفل الذي يولد بشفة مشقوقة لا يوجد لديهم هرمون نمو. تعرض الطفل للإشعاعات او تعرضه للحوادث قد يؤدي الى خلال الغدة المذكورة سابقاً. 

وعلى العموم نقص هذا الهرمون لن يكون مشكلة في هذه الايام لانه موجود هرمونات صناعية تحل محله ويستطيع الأهل إعطاء الطفل هذا الهرمون اذا قرر الطبيب ذلك.